目前科研論文的發(fā)表，尤其是關(guān)于DNA測序的文章，往往需要原始數(shù)據(jù)（序列）上傳至相應(yīng)的第三方平臺，其中以美國國家生物技術(shù)信息中心National Center for Biotechnology Information (NCBI)為主。Algae-Hub聯(lián)手《湖泊科學(xué)》，推出藻類數(shù)據(jù)發(fā)表共享平臺，希望能和各位同行一起關(guān)注和研究藻類，推動我國藻類學(xué)研究和發(fā)展。同時(shí)，探索我國的生物資源信息化建設(shè)。

1. 應(yīng)用實(shí)例

江西師范大學(xué)和中科院水生生物研究所團(tuán)隊(duì)從柘林湖分離得到24株長孢藻，經(jīng)形態(tài)鑒定分屬4個種類，相關(guān)研究成果發(fā)表于領(lǐng)域內(nèi)權(quán)威期刊《湖泊科學(xué)》。研究中所有藻株的16S rRNA基因全長序列已上傳至Algae-Hub基因庫，并生成唯一的Algae-Hub基因庫編號，研究人員可直接在Algae-Hub上搜索獲取序列信息，同時(shí)也可以使用網(wǎng)站序列比對功能進(jìn)行序列分析。

圖1 文章研究方法流程圖

圖2 24個藻株在Algae-hub基因庫的序列號

2. Algae-Hub藻類核酸序列信息數(shù)據(jù)共享平臺

Algae-Hub匯編了中國藻類形態(tài)分類信息，包含了藻種中文名、拉丁名、代表性圖片、形態(tài)特征描述、生境描述等各個方面的信息，目前已經(jīng)完成常見的兩百余種藻種的形態(tài)信息整理與發(fā)布。藻類形態(tài)數(shù)據(jù)庫不僅提供了藻類在線搜索查詢功能，也是實(shí)現(xiàn)人工智能圖像識別的基礎(chǔ)資源，Algae-Hub團(tuán)隊(duì)全力推進(jìn)藻類圖像快速識別在藻類生物監(jiān)測等領(lǐng)域的應(yīng)用。

Algae-Hub藻類數(shù)據(jù)基因庫是Algae-Hub團(tuán)隊(duì)搭建的藻類分子數(shù)據(jù)庫平臺，包含了4部分內(nèi)容：Gene Bank、My Data Pool、Identificataion、Phylogenetic Tree。

3. 基因數(shù)據(jù)的在線發(fā)表

Alage-Hub致力于藻類學(xué)研究資源共享的大數(shù)據(jù)平臺，結(jié)合形態(tài)學(xué)、分子生物學(xué)，以及代謝組學(xué)和蛋白組學(xué)等數(shù)據(jù)，并通過數(shù)據(jù)的整合和校驗(yàn)，搭建了藻類研究的數(shù)據(jù)在線發(fā)表與共享平臺。李仁輝團(tuán)隊(duì)Dolichospermum相關(guān)藻株的16S rRNA和ITS序列數(shù)據(jù)已提交公布于Algae-Hub數(shù)據(jù)庫。

Algae-Hub目前接收在線發(fā)表的數(shù)據(jù)包括物種高質(zhì)量圖片、核酸序列（含單藻株分子標(biāo)簽序列、基因組、轉(zhuǎn)錄組、宏基因組和宏轉(zhuǎn)錄組等數(shù)據(jù)，測序類型包括一代、二代和三代測序數(shù)據(jù)）、代謝組數(shù)據(jù)、蛋白組數(shù)據(jù)。Algae-Hub將聯(lián)手《湖泊科學(xué)》，共同探索藻類數(shù)據(jù)發(fā)表共享平臺！