2020年8月，中國科學(xué)院南京地理與湖泊研究所史小麗研究團(tuán)隊(duì)在BMC Genomics上發(fā)表文章《Genome analyses provide insights into the evolution and adaptation of the eukaryotic Picophytoplankton M.homophaera》，我公司對(duì)該文章進(jìn)行深入解讀。

研究團(tuán)隊(duì)基于流式細(xì)胞分選技術(shù)及劃線分離法，成功獲得M.homophaera藻株，并對(duì)分離自典型富營養(yǎng)化湖泊巢湖的超微真核藻M.homophaera的核基因組及其細(xì)胞器進(jìn)行PacBio三代測(cè)序，首次完成湖泊超微真核藻全基因組測(cè)序工作，并揭示了M.homophaera對(duì)富營養(yǎng)化湖泊的適應(yīng)及進(jìn)化機(jī)制。

研究主要成果包括：

（1）構(gòu)建M.homophaera系統(tǒng)發(fā)育樹，驗(yàn)證其系統(tǒng)發(fā)育地位。

圖1 M.homophaera基于18S rDNA構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹

（2）分析發(fā)掘M.homophaera核基因組及其細(xì)胞器基因組結(jié)構(gòu)特征。

圖2 M.homophaera及其同源物種核基因組、細(xì)胞器基因組結(jié)構(gòu)特征比較

圖3 M.homophaera細(xì)胞器基因組結(jié)構(gòu)圈圖

（3）分析M.homophaera同源基因。

圖4 M.homophaera與其它近源物種的同源基因比較

（4）分析M.homophaera基因功能信息。

圖5 KEGG功能注釋

（5）闡明M.homophaera對(duì)富營養(yǎng)化湖泊的適應(yīng)機(jī)制。

圖6 M.homophaera碳水化合物代謝、營養(yǎng)運(yùn)輸和感光效應(yīng)

（6）構(gòu)建M.homophaera生物質(zhì)能代謝通路。

圖7 M.homophaera脂肪酸生物合成途徑(a)和TCA（甘油脂質(zhì)）代謝途徑(b)

該研究的高通量測(cè)序及部分生物信息學(xué)分析服務(wù)由我公司提供。宏眾百德專注于高通量測(cè)序及生物信息分析技術(shù)在微生態(tài)及藻類研究中的應(yīng)用。本研究獲得藻種全基因組精細(xì)圖，并通過生物信息分析深度分析解釋各種生物學(xué)問題。

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