基于分子標(biāo)記的藻類鑒定研究進(jìn)展

近期，宏眾百德參與的一篇綜述文章在《湖泊科學(xué)》雜志發(fā)表。

 摘要：

 藻類鑒定被廣泛應(yīng)用于藻類遺傳學(xué)、生理學(xué)、生態(tài)學(xué)和應(yīng)用藻類學(xué)，尤其是藻類調(diào)查和評(píng)估. 然而，基于形態(tài)學(xué)的鑒定往往因?yàn)榉诸愄卣魑闯霈F(xiàn)或不典型、設(shè)備限制和人員經(jīng)驗(yàn)欠缺等原因帶來較大誤差. 隨著測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展，分子標(biāo)記已成為藻類鑒定的一個(gè)通用工具. 由于藻類類群眾多且差異很大，分子標(biāo)記的選擇成為藻類鑒定的關(guān)鍵. 本文綜述了藍(lán)藻、硅藻、綠藻、甲藻、裸藻、隱藻、金藻、黃藻、紅藻和褐藻等主要門類分子標(biāo)記的選擇及應(yīng)用進(jìn)展，包括分子標(biāo)記選擇原則、常用標(biāo)記和相應(yīng)序列數(shù)據(jù)庫，以及各個(gè)分子標(biāo)記在不同類群應(yīng)用中的優(yōu)缺點(diǎn)等. 藻類分子鑒定源于編碼核糖體RNA的基因（rDNA），發(fā)展于細(xì)胞核、線粒體、葉綠體DNA等. 然而，當(dāng)前藻類分子鑒定逐漸細(xì)化和完善，單一的核糖體DNA、內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)（ITS）和保守蛋白編碼基因等短序列分子標(biāo)記已經(jīng)很難滿足藻類鑒定的需求，多標(biāo)記組合成為一種必然選擇. 同時(shí)，線粒體基因組、葉綠體基因組、核基因組、轉(zhuǎn)錄組和宏基因組等提供了更多遺傳進(jìn)化信息，彌補(bǔ)了短序列分子標(biāo)記在系統(tǒng)分類應(yīng)用中的不足. 對(duì)于藻類鑒定，單純依賴分子標(biāo)記或形態(tài)學(xué)都不足以保證鑒定的準(zhǔn)確性，采用將分子生物學(xué)、形態(tài)學(xué)、生理生化學(xué)等結(jié)合的多相學(xué)方法，才能準(zhǔn)確地完成鑒定工作. 此外，藻類分子數(shù)據(jù)庫的建立和完善是未來分子鑒定的重要工作，快速鑒定方法也必將在未來獲得廣泛的應(yīng)用和發(fā)展. 

文獻(xiàn)下載：

張軍毅, 孫蓓麗, 朱冰川等. 基于分子標(biāo)記的藻類鑒定研究進(jìn)展. 湖泊科學(xué), 2021, 33(6). DOI: 10.18307/2021.0601 Zhang J, Sun B, Zhu B et al. Research progress in the taxonomic identification of algae on the basis of molecular markers. J. Lake Sci., 2021, 33(6). DOI: 10.18307/2021.0601